@remenca @spla Jo de fet faig servir molt java ... des de python ... implementat a la JVM! Una colla d'exemples per a processament d'imatge: https://syn.mrc-lmb.cam.ac.uk/acardona/fiji-tutorial/

El jython és un python 2.7, vell, vetust, però fa la feina.

Les llibreries són totes en java, com la #imglib2 que és reboníssima, i que, gràcies a tot de ponts (com el jpype), es pot fer servir des del python convencional. Vegeu imglyb https://github.com/imglib/imglyb i pyimagej https://pypi.org/project/pyimagej/

@remenca @spla @marcbeldata

Doncs ...

#BigStitcher https://www.nature.com/articles/s41592-019-0501-0

#BigDataViewer https://www.nature.com/articles/nmeth.3392

#ImgLib2 https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/28/22/3009/240540

#CATMAID https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/25/15/1984/210794

Elastic volume registration https://www.nature.com/articles/nmeth.2072

#vEM #volumeEM https://l1em.catmaid.virtualflybrain.org/?pid=1&zp=59900&yp=36430.399999999994&xp=32311.00000000001&tool=tracingtool&sid0=1&s0=3